WinSCPはレジストリ以外にINIファイルに設定を保存できます。
IniファイルはWinScp.exeと同じディレクトリに保存されます。Iniファイルの保存先(標準)
になります。WinScpはカレントディレクトリを設定に書き出す。
Windows Vista/7 からはprogram files に書き出すと、VirtualStoreが有効になってこれまたややこしい。
そこで明示的にINIファイルの置き場所を指定する。
起動ショートカットで、ファイルを指定する。
winscp3.exe /ini=<inifile>/ini パラメータでコンフィギュレーション INI ファイルのパスを与えることも出来る。そうすると, コンフィギュレーションの保存としてレジストリーを使用しない。
http://www.tab2.jp/~winscp/about.html
とのこと。コレは便利だ。